由于使用手提式高压灭菌锅的时候，锅内会产生高压，因此有一定的危险性，虽然现代研发的手提式高压灭菌锅在安全性能方面都有较大的提高，但是如果操作不规范的话，仍然会对操作人员存在危险，而且也有可能导致灭菌不彻底等，因此在使用手提式高压灭菌锅时，需要注意以下事项：
1.在灭菌过程中，应注意排净锅内冷空气，锅内冷空气如排放不净，会影响灭菌效果，达不到彻底灭菌的目的。这是由于空气的膨胀压大于水蒸汽的膨胀压，所以，当水蒸汽中含有空气时，在同一压力下，含空气蒸汽的温度低于饱和蒸汽的温度，因此会影响杀菌效果。
2.灭菌物品不能堆得太满、太紧，以免影响温度均匀上升。太紧密会隔绝空气流动，也就影响了温度的均匀上升。
3.降温时待温度自然降至60℃以下再打开箱门取出物品，以免因温度过高而骤然降温，导致玻璃器皿炸裂。其实在日常的生活中，大家都会有这样的经验，因此这一点比较好理解。
4.由于高压蒸汽灭菌时，要使用温度高达120℃、两个大气压的过热蒸汽，操作时，必须严格按照操作规程操作，否则容易发生意外事故，这一点需要特别注意。
在使用手提式高压灭菌锅的过程中，有两个问题一定要注意，其一是要保证手提式高压灭菌锅的杀菌效果，不能因为担心其他的问题就忘记了手提式高压灭菌锅的本质，它的主要作用就是用于高温灭菌的，因此，任何时候都不能忘记了这一点。其次就是要注意安全，高温杀菌的过程中，不仅会产生高热蒸汽，而且会产生高压，如果操作不规范，就极易发生意外，因此在人员安全保障方面，一定要做足措施，比如在操作之前加强相关人员的技术培训，熟练掌握手提式高压灭菌锅的操作规范，在操作的过程中，一定要认真，严格按照操作规范进行操作，最大限度保证操作人员的安全。