高通量种子研磨仪是种子检测机构中的必备仪器，其不仅适用于对硬性、中硬性和脆性样品的细粉碎和精细研磨，还适用于软性、弹性、纤维质材料等。因为设备属精密设备，在实验过程中一定要按照正确方法操作。而且每一种样品的研磨方法也不同，因此需要认真对待。
一、玉米叶片研磨方法如下：
1）取样：取新鲜玉米幼苗叶片，剪成直径6~8mm大小碎片；
2）将3-5片叶片碎片置于2ml离心管中，同时加入1颗5mm和2颗3mm不锈钢研磨钢珠。
3）将加入叶片和研磨钢珠的EP管关盖密封，放入高通量种子研磨仪研磨玉米叶方法的2ml研磨适配器中，然后和适配器一起整体进入液氮冷冻2-3分钟或至液氮不“沸腾”为止。
4）迅速从液氮中取出适配器，并迅速将其固定在研磨仪的摇臂中；
5）设置研磨时间为2分钟，研磨频率1500rpm。
二、水稻叶片研磨方法如下：
1）将离心管编号，对应编号将相应的水稻叶片截成1cm左右的小段，每个离心管中放3段，用镊子夹住中间位置，放入管底。
2）分装珠子：内侧两排装2颗5mm珠子和5颗3mm珠子；外侧两排装1颗5毫米珠子和6颗3mm珠子。
3）冷冻：将摆好的夹具（确定好内外行），放到泡沫箱中，加液氮冷冻，3-5分钟，充分冷冻夹具及管内样品。
4）在高通量种子研磨仪上设定：1500rpm，研磨3min。
5）研磨：在上夹具时，要注意一是要带上厚一点的手套，防止被液氮冻伤；一是要迅速，且要保证螺栓拧紧，卡上保险扣。然后，启动研磨。
6）取下夹具，使整体离心管盖子向上，在桌面上拍一拍，使样品粉末沉落管底，进行下一步实验。