林木种质资源是人类宝贵的遗产，更是森林得以延续发展的基础，因此在当前自然资源造成严重破坏的背景下，利用林木种质资源库来开展林木种质资源的收集和保存工作，是当前林业生态体系和林业产业体系建设的重要内容。
林木种质资源保护的包括收集、保存和管理三个部分，收集相对来说较为简单，但是保存的话，就需要借助专业的设备林木种质资源库了，这是因为这些林木种质资源并不是仅仅保存一两年的，而是需要长期保存的，以备在今后的科研工作中，能够随时调出使用，因此储藏的期限是比较长的，这就对储藏的条件提出了更高的要求，常温和普通的种子储藏设备是难以满足要求的，而只有依靠林木种质资源库，才能够保证这些林木种质资源依然能为大家所用。
另外一个重要的方面，那就是林木种质资源库的应用，可以保障林木种质资源收集保存工作有序开展，使保护人员不用考虑保存的问题，只需要专心将精力用在收集和管理这部分，使更多的林木种质资源能够得到保护，也让林木种质资源的信息编辑工作更加细致，在查找的时候，也能够更加清楚了解到不同种类的林木种质资源信息，更好的开展育种培育等工作，进一步开发和利用这些保存的种质资源。
而随着近年来各地对林木种质资源保护的重视，各地都在积极展开收集和保存工作，而在保护的过程中，林木种质资源库为保护工作提供了重要的保证，进一步确保了资源良好、健康的保存，对于完善和改进资源保存的措施和方法也有重要的意义。